“新型冠状病毒基因组数据分析综合平台”免费向科研人员开放
测序中国  今天


新型冠状病毒疫情对我国人民的生产生活产生了较大影响，牵动着大家的心。举国上下都十分重视，一线医护人员冲在了抗击疫情的最前线，各方也都从各方面提供着各种援助。
作为一种新型冠状病毒，我们对它的了解还不够，临床科学家们也在想尽各种办法加班加点研究这种新型冠状病毒，以便尽快研究清楚它的生物学分子机理，正如1月26日，在国务院新闻办疫情新闻发布会上，中国疾病预防控制中心主任高福院士表示的，要结合多种技术手段来帮助做病毒的解析。当前，国内三代测序和生物云服务提供商百迈客，结合其技术特点，也积极地参与到抗击疫情的战斗中，为抗击疫情贡献一份力量。
据悉，针对此次疫情，百迈客积极与一线的医护和科研人员合作，结合一线的需求，经过十几天夜以继日的开发，第一版新型冠状病毒（nCov）基因组数据库分析平台上线，为一线科研人员提供免费服务。现把阶段性开发进展和支持方式公布如下，希望对加快破解和管控疫情提供有效支撑。
“病毒数据库&自动化分析平台/工具” 向社会免费共享
自2019年12月疫情首现以来，百迈客研发团队及时跟进疫情研究进展。目前已完成一期研发计划，通过对各数据库中的新型冠状病毒数据进行合理整合分析，及时搭建了首版“新型冠状病毒数据库分析平台”(http://ncovdb.biocloud.net/home) ，该数据库于2020年1月27日20:00时正式上线，将配合国家公共资源数据库为社会提供更全面、及时、准确的数据资源。

数据库部署了31个新型冠状病毒基因组序列，其中MN938384、MN908947、MN975262等菌株均已补充详细的基因组、编码基因及蛋白序列信息，我们还基于这31个菌株，2株MERS作为外源构建了物种进化树，以便更清晰解读新型冠状病毒的进化树起源。研究人员可便捷下载基因组数据资源，亦可通过我们部署的Blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相关的初步数据分析、挖掘。
我们将持续跟进、并更新该数据库，为国内外科研工作者提供方便快捷的数据检索及下载服务。在随后的二期、三期研究计划中，我们会继续部署各种自动化分析工具，分析保守域、菌株间的变异信息，寻找菌株间的共性的突变信息，为病毒致病机理的研究、疫苗的开发等提供技术支持。
三代纳米孔技术助力病毒变异监测
三代测序技术作为基因组学研究的新兴技术，对病毒的组学研究有着重要作用，作为全球领先的三代测序技术服务提供商，百迈客生物与战略合作伙伴Oxford Nanopore公司联合协调了5套MinION测序平台及配套试剂盒，各位疫情防控专家如有需求，联系评估后随时无偿配发，保证前线专家做好对疫情的实时监控、及时分析；如有建好的2019-nCov病毒测序文库也可以结合送样要求与其取得联系。
附录：样品要求
已配备专业生物信息分析团队，并向社会无偿提供信息分析技术支持
据悉，疫情爆发以来，百迈客生物组织20余人的生信分析团队不断针对发布的病毒基因组进行研究分析，随时待命加入抗击疫情的队伍。同时，该公司亦诚恳邀请、欢迎各位专家学者共同探讨疫情防控良策，请联系18514282648（微信同号）进群讨论。
其它可调配资源
百迈客生物表示，如果前线专家需要其它生物技术支持资源，该公司将不遗余力提供最大的帮助。
24小时对接联系人

数据库使用&数据分析对接人：
负责人：王老师
手机：18514282648（同微信）
邮箱：wangf@biomarker.com.cn
样品准备&测序对接人：
负责人：康老师
手机：16622926288（同微信）
邮箱：kangjm@biomarker.com.cn https://mp.weixin.qq.com/s/ZJodHSBfIALTQDA3S-xXBw
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修改:purplesoul FROM 112.96.40.*
FROM 112.96.40.*