- 主题:对于中科院新冠病毒基因组数据分析文章以及病毒起源的看法
这个研究工作,让我想起了非常有名的一本书《出非洲记·人类祖先的迁徙史诗》,通过对人类基因组进行分析,得到关于人类起源、人类迁移的线索。也就是通过书里介绍的线索,说明,整个人类都是起源于非洲,是在6、7万年一批批走出非洲,到世界各地。
有一段我记忆特别深刻:因为非洲是人类的起源地,所以非洲人类的基因多样性是最为丰富的,而相对而言,中国虽然人口很多,但是基因多样性远远比不上非洲。
所以目前,在美国发现了种类最为丰富的基因多样性,并且发现了进化史上更为靠前的族群,所以才推论美国才是疫情的发源地。这也就是为什么台湾的节目中怀疑为什么美国才是真正的起源。
对于这种说法,有记者采访了兰州大学研究员赵序茅:
新冠病毒源头在美国?专家解读来了_财经_中国网
http://finance.china.com.cn/roll/20200229/5208251.shtml
赵序茅研究院说,目前不能完全下这种结论,原因是:
美国病患是较为古老的单倍型H38,而这位美国病患来过武汉,所以说虽然美国病患是较为古老的单倍型,但也有可能是2019年12月底至2020年1月初在武汉感染的。
对此我的也有疑问,我们最近通过新闻得知,美国的新冠肺炎测序的标准很高,只有到过中国或者接触过中国人的病人才会进行核酸检测,那其实无论如何,发现的病例都会有理由说是从中国感染的。为什么不能怀疑,这个美国人到武汉之前就已经感染了呢?
2. 现有武汉样本,为何没检测到“爷爷辈”单倍型?论文研究团队认为,这可能是因为现有样品主要采自几家定点医院,而且样品采集时间局限于2019年12月24日和2020年1月5日。赵序茅研究员的解释是:“武汉因为采集时间较晚,此时爷爷辈的单倍型很有可能已经被父辈、孙子辈的单倍型替换了。”
我觉得这个解释也有疑问,即使爷爷辈的单倍型被替换,那在武汉也应该检测到最为丰富的基因多样性,为什么武汉的样本中多样性相对更为单一呢?对此我的解释是,采集样本病人来源比较单一,集中在某一个医院中,这些病人可能是在医院就医过程中发生了院内感染,感染源是这个医院初期就诊的某一个病例,而其他医院的数据目前不全,没有进行充分的数据分析。另外一个解释是,在武汉发生了超级传播事件,导致大部分武汉病人体内的病毒只是来源于某一个病例。但是我认为以上解释可能性比较小。
3. 论文作者郁文彬也曾在接受有关采访时坦陈,这项研究有个不足,那就是93个样本中,武汉样本主要是早期的,如果有更多武汉样本进行基因组测序的话,可能在溯源方面可以找到更多的证据,比如说找到 H13 和 H38 单倍型,可能可以帮助找到病毒来源。
这个解释我认为同样有问题,如果武汉的93个样本是早期的,而其他地方的样品(包括美国等地的样品)是更为晚期的话,如果病毒真的是起源于武汉,那武汉的样品应该会是更为古老的单倍型,而不应该是现在数据中心呈现的是更为年轻的单倍型。
所以目前结合美国CDC发现有不明来源的病例,和中国没有流行病学上关联这一事实,以及日本游客从夏威夷归国确诊(中间没有接触中国人)这一事实,其实病毒起源于哪里已经昭然若揭了。即使这个病毒不是起源于某国,那某国可能也比中国更早发生了新冠病毒的流行。我相信钟南山院士说病毒并非起源于中国,并非空穴来风,国家层面可能已经掌握了更多的证据,钟南山院士应该是出来吹风的。目前没有确切的向世界宣布,可能还是因为某国核酸检测数据太少,导致目前证据比较弱,无法说服世人。日本、台湾都已经开始怀疑某国,我不相信旋涡中心的我国没有此方面的怀疑,并对病毒的起源地进行更为严密的追踪。相信我国手上证据丰富、让人无法质疑的时候,就是真相大名的那一天。
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FROM 39.65.125.*
染上H38的3个美国人2019年12月底到达武汉,2020年1月15日离开武汉后,回到美国发病。染上H13的4个深圳人2019年12月29日到达武汉,2020年1月4日全都回到深圳。其中1人是个小孩,回到深圳后与其奶奶同住,于是将H13传染给他的奶奶。
如果你愿意判断这些美国人是在武汉感染上病毒的,那么你就把病毒样本H38划归武汉的病毒样本比较合理。你如果愿意判断是这些美国人在去武汉之前就携带着H38,那么就把病毒样本H38划归美国比较合理。深圳5人携带的H13病毒如果在去武汉之前就染上了,那么你将病毒样本H13划归广东比较合理,如果该病毒是他们到了武汉才染上的,那你将病毒样本H13划归武汉比较合理。
武汉有B组病毒样本(H3,不能排除存在H38)、C组病毒样本(H1),以及C组衍生的D、E组病毒样本,也不能排除存在A组病毒样本(H13),这样武汉现在还不能排除具有五毒俱全的可能性。
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修改:Yanght56 FROM 114.252.36.*
FROM 114.252.36.*
人家文章里明明写的是缺乏武汉早期样本
【 在 ccliu88 的大作中提到: 】
: 这个研究工作,让我想起了非常有名的一本书《出非洲记·人类祖先的迁徙史诗》,通过对人类基因组进行分析,得到关于人类起源、人类迁移的线索。也就是通过书里介绍的线索,说明,整个人类都是起源于非洲,是在6、7万年一批批走出非洲,到世界各地。
: 有一段我记忆特别深刻:因为非洲是人类的起源地,所以非洲人类的基因多样性是最为丰富的,而相对而言,中国虽然人口很多,但是基因多样性远远比不上非洲。
: 所以目前,在美国发现了种类最为丰富的基因多样性,并且发现了进化史上更为靠前的族群,所以才推论美国才是疫情的发源地。这也就是为什么台湾的节目中怀疑为什么美国才是真正的起源。
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FROM 124.64.19.*