COVID-19病人支气管免疫细胞单细胞测序分析
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文章信息
题目：Single-cell landscape of bronchoalveolar immune cells in patients with COVID-19
投稿日期：2020年2月24日
接收日期：2020年4月23日
发表日期：2020年5月12日
杂志：Nature Medicine
文章在：https://www.nature.com/articles/s41591-020-0901-9
DOI：https://doi.org/10.1038/s41591-020-0901-9
文章使用的代码在：https://github.com/zhangzlab/covid_balf

2 前言
2.1 摘要
与COVID-19严重性相关的呼吸免疫特性目前还不清楚。作者选了COVID-19严重程度不同的患者以及健康人的支气管肺泡灌洗液免疫细胞，进行单细胞转录组测序。发现重度患者的支气管肺泡灌洗液中富含巨噬细胞，普通型患者的特点是存在高度克隆扩增的CD8+ T细胞。
支气管肺泡灌洗（bronchoalveolar lavage, BAL）：经支气管镜向局部支气管肺泡注入生理盐水，随即进行抽吸而获取支气管肺泡表面被覆液与灌入生理盐水混合液的一种方法。BAL可通过支气管肺泡灌洗液（bronchoalveolar lavage fluid, BALF）细胞学、肿瘤标志物等检测解决常规支气管镜未能见到的异常肺部病变的诊断，特别是周围性、原发性或继发性恶性肿瘤等，往往被称为“液相活检” （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6000434/）
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