https://mp.weixin.qq.com/s/P7QYJwM5Bm5e2J68ls1L0ANat Immunol丨小鼠免疫系统的microRNA表达和调控元件活性图谱
IF:20.476
2021年6月7日
为了更好地定义免疫系统调节的控制,研究人员从63个小鼠免疫细胞群中生成了一个 microRNA (miRNA) 表达图谱,并将这些特征与ATAC-seq、ChIP-seq以及新生RNA谱连接起来,以建立miRNA启动子和增强子在免疫细胞中的使用图谱。miRNA的复杂性相对较低,每个群体中>90%的miRNA区室是由<75个miRNAs组成;然而,每种细胞类型都有一个独特的miRNA特征。miRNA表达与染色质可及性的整合揭示了差异表达miRNA的假定调控元件,包括miR-21a、miR-146a和miR-223。整合图谱表明,许多miRNAs利用多个启动子达到高丰度,并在谱系之间和发育过程中鉴定了显性和不同的miRNA调控元件,这些调控元件可能被集群的miRNAs(如miR-99a/let-7c/miR-125b)使用,以实现不同的表达。这些研究以及可通过网络访问的数据,有助于描绘控制免疫系统miRNA特征的顺式调控元件。
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34099919/
Blood丨MiR-130b和miR-128a是t(4;11) MLL-AF4 急性白血病的必要谱系特异性协同驱动因子
IF:17.544
2021年6月10日
t(4;11) MLL-AF4 急性白血病是婴儿和儿科人群中最具侵袭性的恶性肿瘤之一,但对于导致疾病进展的分子机制知之甚少。这阻碍了一种可以解决MLL-AF4驱动的白血病发生的侵袭性表型和谱系可塑性的治疗方案的开发。本研究通过关注来自原代患者样本的白血病原始细胞中上调的两种microRNA:miR-130b和miR-128a,突出了疾病发展的新机制。研究表明,miR-130b 和miR-128a是MLL-AF4的下游靶标,并且可以单独驱动完全小鼠Mll-AF4体内模型从白血病前期阶段向急性白血病的转变。它们还需要维持疾病表型。有趣的是,miR-130b过表达导致mixed/B细胞前体/髓系白血病,由淋巴引发的多能祖细胞群繁殖,而miR-128a过表达导致pro-B急性淋巴细胞白血病,由高度扩增的Il7r+ckit+原始细胞群维持。这两种miRNAs诱导的分子和表型变化完全重现了人类疾病,包括中枢神经系统浸润和MLL-AF4表达特征的激活。此外,本研究确定了这些microRNAs的两个下游靶标NR2F6和SGMS1,它们在广泛的验证研究中被证实为MLL-AF4+白血病的新型肿瘤抑制因子。因此,本研究的综合方法为鉴定MLL重排白血病的关键共同驱动因子提供了一个平台,可以剖析白血病前期向白血病的转变和谱系可塑性,并可以测试新的治疗方法。
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34111240/
Blood丨MicroRNA-497/195具有抑瘤作用并与CDKN2A/B合作治疗小儿急性淋巴细胞白血病
IF:17.544
2021年6月7日
之前的研究确定了(移植到NOD/SCID小鼠中的)患者源性白血病细胞的快速植入与B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)早期复发的关联。为了寻找与该表型相关的细胞和分子图谱,本文研究了不同移植表型和患者预后中microRNAs (miRNAs)的表达,并发现移植缓慢的患者来源的异种移植样本中存在高miR-497/195表达,这些样本来自预后良好的患者。相比之下,在与早期复发相关的快速移植样本中,观察到这些miRNAs的表观遗传抑制和低表达。患者源性白血病细胞中miR-497/195的过表达抑制了白血病的体内生长,并延长了受试者的生存期。相反,抑制miR-497/195会导致白血病细胞生长增加。miR-497/195过表达导致了关键细胞周期调节因子被下调,本研究鉴定出CDK4/CCND3介导的G1/S转换控制是miR-497/195抑制BCP-ALL进展的主要机制。在另一组独立的患者样本中的发现强调了miR-497/195介导的细胞周期调节的关键作用,表明miR-497/195的高表达以及 CDKN2A/B 的完整序列与极好的预后相关,而CDKN2A/B的缺失以及miR-497/195的低表达则与明显较差的无复发生存率相关。这些发现表明,细胞周期调节因子的协同缺失作为新的预后因子,暗示可能是小儿BCP-ALL的潜在治疗靶点。
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34098582/
Hepatology丨转录组学分析揭示了负责与酒精性肝炎死亡率相关的肝再生的miRNAs
IF:14.675
2021年6月7日
本研究进行了全面的血清转录组学分析,以探讨miRNA在酒精性肝炎(AH)发病机制中的作用及其预后意义。对15名对照、20名无肝病的重度饮酒者和65名AH患者进行了血清miRNA表达谱分析,并与公开可用的AH患者肝脏miRNA表达谱进行了比较。在前26个miRNAs中,miR-30b-5p、miR-20a-5p、miR-146a-5p和miR-26b-5p在AH患者的血清和肝脏中的表达均显著降低。对这些miRNAs的潜在靶点进行通路分析,发现了与DNA合成和细胞周期进程通路相关的基因,包括RRM2、CCND1、CCND2、MYC和PMAIP1。本研究发现在接受肝移植的AH患者中RRM2、CCND1 和 CCND2的蛋白表达显著增加,但MYC和PMAIP1的蛋白表达没有显著增加;miR-26b-5p和miR-30b-5p抑制RRM2和CCND2的3'-UTR荧光素酶活性,miR-20a-5p降低CCND1和CCND2的3'-UTR荧光素酶活性。在346天的中位随访期间,21% 的AH患者死亡;这些患者的BMI、MELD、血清miR-30b-5p、miR-20a-5p、miR-146a-5p和 miR-26b-5p高于存活患者。Cox回归分析显示BMI、MELD评分、miR-20a-5p、miR-146a-5p和miR-26b-5p预测死亡率。
结论:AH患者试图通过下调特定miRNAs和上调负责DNA合成和细胞周期进程的基因来应对肝细胞损伤。这些miRNAs的高表达表明肝再生能力减弱,预示着AH患者的短期死亡率。
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34096637/
Ageing Res Rev丨miR-21和miR-146a:炎症和衰老相关疾病的microRNAs
IF:10.618
2021年5月31日
2001年发表的第一篇关于“炎症”的论文为一个统一的理论铺平了道路,该理论解释了衰老如何以及为何成为最常见的年龄相关疾病(ARDs)发展的主要风险因素。这个主题最令人兴奋的挑战是解释全身性炎症是如何随着年龄的增长而急剧增加的,以及为什么它在相同年龄的个体中表现出不同的发生率。过去二十年的“表观遗传革命”表明,对个体基因组成的评估不足以描绘与年龄相关炎症的轨迹。因此,科学家们一直关注非编码RNA(如microRNAs)在炎症中的作用。最近10年获得的结果支持了我们称为inflammamiRs的miRNA子集的关键作用,因为它们能够控制NF-κB驱动的炎症通路。本文综述中,作者将重点关注两种inflammamiRs,即miR-21-5p和miR-146a-5p,它们靶向多种属于NF-κB/NLRP3通路的分子。在衰老和ARDs的背景下,miR-146a-5p和IL-6之间的相互作用也将被强调。作者还将提供最相关的证据,表明循环inflammamiRs和 IL-6可以测量炎症程度。
原文链接:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34082077/
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