1.0 绝对的垄断者——10x和BD平台
在单细胞测序领域,10x和BD平台以每年近万篇的科研成果和95%的市场份额成为绝对的垄断者,尤其是10x Genomics 公司生产的微流控单细胞测序仪,是单细胞“科服商”的信仰。
(1)10x Genomics—Chromium平台
10x Genomics Chromium单细胞平台通过微流控芯片技术获得单细胞反应体系,并在传统文库构建的基础上引入标签,通过追溯标签序列将众多mRNA、表面蛋白信息定位回原来的单个细胞。用于完成单细胞3’和5’RNA测序文库构建以及单细胞表面蛋白检测文库构建等。
平台特点:
细胞通量高:一次可以同时做8个样本,细胞通量高达80000+个细胞;
捕获率高:细胞捕获率最高可达65%;
短时高效:十几分钟内可完成上万个细胞封装,一天内获得测序文库;
双细胞发生率低:多细胞率低于0.9%/1000cells;
针对V(D)J分析,可检出单个细胞的配对的TCR/BCR双链V(D)J全长序列;
针对ATAC分析,线粒体污染率低于2%;
适用性广:可进行单细胞转录组,免疫组,蛋白组,表观组多组学研究。
(2)碧迪医疗—BD Rhapsody平台
BD公司推出Rhapsody(TM)单细胞分析系统,能为单细胞中每个转录本标记特异性分子标签,实现单细胞水平上基因表达谱的绝对定量。同时,每个细胞也会被标记特异性细胞标签,使得高通量平行建库成为可能。结合Rhapsody特有的单细胞分离技术,单次实验可制备100-10000个单细胞文库,用户可根据需求定制引物,将检测范围集中在目标基因,大幅降低后续测序成本。
平台特点:
高样本兼容性:实现多样本混合捕获,微孔板的孔数高达22万个;
超高捕获效率:细胞捕获率最高可达80%;
实时观察:备成像系统,可观察细胞相关信息;
适应性广:可以实现转录组-蛋白组联合分析。
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