Potential drug targets for multiple sclerosisidentified through Mendelian randomization analysis
利用国际多发性硬化症遗传学联合会(nCase = 47 429,nControl = 68 374)的汇总数据,并在英国生物银行(nCase = 1356,nControl = 395 209)和芬兰基因队列(nCase = 1326,nControl = 359 815)中进一步验证,进行了孟德尔随机化,以探索多发性硬化症的潜在药物靶点。
734 种血浆蛋白和 154 种CSF蛋白的遗传变异来自最近发表的全基因组关联研究。
为了进一步巩固孟德尔随机分析的结果,利用双向孟德尔随机化分析和 Steiger 过滤、贝叶斯共定位和表型扫描 [phenotype scanning] 进行了反向因果关系推测,以寻找之前报道的遗传变异与性状的关联。
此外,还进行了蛋白互作网络分析,以揭示蛋白质和/或现有多发性硬化症药物之间的潜在关联。
目的是什么?
将血浆蛋白和CSF(脑脊液总蛋白)蛋白作为多发性硬化症的潜在治疗靶点。
具体如何实现?
首先,我们利用国际多发性硬化症遗传学联合会(IMSGC)的 GWAS 数据、Zheng 研究中的血浆 pQTL 数据和 Yang 研究中的 CSF pQTL 数据,使用 MR 来识别多发性硬化症的潜在的致病血浆和 CSF 蛋白质成分。
其次,利用反向因果关系检测、贝叶斯共定位分析和表型检测进一步验证了主要发现。
第三,我们绘制了已识别蛋白质之间、基于血浆和 CSF 的蛋白质之间以及已识别蛋白质与当前多发性硬化症药物靶点之间的相互作用网络。
最后,我们利用英国生物银行和芬兰基因队列中的 GWAS 数据以及两项新发表的研究中的血浆 pQTL 数据进行了重复分析,作为外部验证,以加强我们的结论。
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