题目:肠道菌群对脓毒症和脓毒症相关死亡的因果影响:来自全基因组孟德尔随机化、单细胞RNA、批量RNA测序和网络药理学的见解杂志:Journal of Translational MedicineIF:7.4发表时间:2024年1月研究背景脓毒症是一种严重的传染病,尽管早期给予抗生素和支持性治疗取得一定进展,但治疗结果仍不理想,故深入了解脓毒症的病理机制并探索新的治疗方法势在必行。有研究显示,肠道菌群改变与脓毒症和相关传染病有关,但因果关系和潜在机制尚不清楚。数据来源 肠道微生物群的遗传数据来自Mibiogen联盟进行的最新全基因组关联研究(GWAS)汇总数据。脓毒症数据来自英国生物样本库(UK Biobank)。脓毒症生存数据来自4个队列的数据:GenOSept(欧洲脓毒症和脓毒性休克遗传学)联盟、GAinS(Genomic Advances in Sepsis)研究、VASST(脓毒性休克中的血管加压素试验)和PROWESS(严重脓毒症蛋白C全球评估)试验。脓毒症患者的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据来自GEO数据库GSE167363数据集。研究思路首先,采用孟德尔随机化(MR)评估肠道菌群与脓毒症之间的因果关系,鉴定了与脓毒症相关的肠道微生物群,从工具变量中鉴定与脓毒症相关的基因。其次,使用单细胞转录组测序技术在脓毒症患者的血液样本中分析和注释了不同细胞类型的基因表达,使用批量RNA测序数据比较了这些基因在健康个体、幸存和未幸存脓毒症患者的表达谱。最后,通过预测和分子对接方法探索了一些基因作为潜在的治疗靶点,并预测了与这些靶点相关的潜在治疗药物。
发自「今日水木 on 23013RK75C」
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