Cell | 单细胞测序+蛋白质组成像，绘制迄今最全面的空间分辨健康人类骨髓图谱
近日，美国宾夕法尼亚大学Tan Kai、秦聆团队合作在Cell上发表了题为“Mapping the cellular biogeography of human bone marrow niches using single-cell transcriptomics and proteomic imaging”的文章。研究团队对29,325个非造血细胞进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，发现了9种不同转录亚型；同时分析了53,417个造血细胞，预测其与非造血细胞亚型的相互作用；并通过索引共检测（CODEX）对超120万个细胞进行空间分析，整合CODEX数据与scRNA-seq数据，将预测的细胞信号与空间邻近性相关联。该研究发现了多种非造血细胞亚型，揭示了人类骨髓中非造血细胞和造血细胞的重要性和相互作用，以及早期骨髓造血过程中特定细胞类型的空间分布。利用CODEX图谱对新图像进行注释，发现了急性髓系白血病（AML）患者样本中骨髓MSC扩增，以及白血病母细胞与MSC共同富集的空间邻域。综上，这一空间分辨的骨髓多组学图谱为研究人类骨髓细胞相互作用提供了参考。
发自「今日水木 on 23013RK75C」
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