Nature | 新方法更准确解析空间转录组中的单细胞
空间转录组目前仍然面临无法准确解析单细胞的问题。虽然现在已经可以获取亚细胞水平的空间转录数据,但是很多时候需要很多spots聚在一起分析,浪费了空间分辨率,还错过很多稀疏的细胞类型。
为此,牛津大学Katherine R. Bull以及Heather A. Harrington等研究人员开发新方法- TopACT(topological automatic cell type identification),通过动态地调整spots聚集大小,结合单细胞转录组参考数据,实现spots分辨率的细胞类型归类,从而更好地还原单细胞空间组织结构,并更灵敏解析稀疏的细胞类型。
发自「今日水木 on 23013RK75C」
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