2024年7月18日,2020年诺贝尔化学奖得主、CRISPR基因编辑技术奠基人之一的 Jennifer Doudna 教授在国际顶尖学术期刊 Science 上发表了题为:Structure-guided discovery of ancestral CRISPR-Cas13 ribonucleases 的研究论文。
该研究将基于AlphaFold2的人工智能的蛋白质结构预测与传统结构比对程序结合,开发出了一种自动化结构检索,发现了Cas13的祖先——Cas13an,并进一步解析了Cas13an的结构及其作用机制,还将Cas13的起源追溯到与防御相关的核糖核酸酶(ribonuclease)。
近年来,在AlphaFold2等人工智能工具的帮助下,结构数据库迅速发展。这给了研究团队以希望——不管氨基酸序列如何,只要寻找相似的结构,就能找到其他Cas13。
在这项研究中,研究团队构建了一个自动化结构检索管线,该管线将基于人工智能的检索方法的速度与传统结构比对程序的灵敏度相结合。利用这个管线,研究团队确定了一个Cas13的祖先分支——Cas13an,并将 Cas13的起源追溯到与防御相关的核糖核酸酶。
发自「今日水木 on 23013RK75C」
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