生信分析方法
从文章的分析流程中提取所有的分析内容,整理出来就11个分析条目,构成了整个文章,本文属于纯生信分析的文章,下面我们就看看哪些分析可以利用桓峰基因公众号的教程来实现,点击分析条码就会跳转到对应公众号的教程,跟着教程做,您也能发5+,如下:
1. 泛癌种DDR基因瀑布图(maftools)
2. 泛癌种DDR基因突变生存分析(Kaplan-Meier)
3. TCGA队列中DDR突变与生存结局的单/多因素分析回归分析
4. 7种不同癌症中DDR突变与预后相关(Kaplan-Meier)
5. 多变量Cox回归模型
6. 单样本基因集富集分析方法评估上述免疫标记的富集分数(ssGSEA)
7. 对TCGA测序数据进行差异分析(DESeq2)
8. DDR基因集富集分析(GSEA)
9. DDR基因通路富集分析(KEGG)
10. 计算肿瘤浸润免疫细胞比例(CIBERSORT)
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