人类生物分子图谱计划(HuBMAP)新进展:基于多模态数据深度整合,实现3D人类参考图谱多维升级
人体生物分子图谱计划(HuBMAP)于2018年启动,旨在构建一个从器官、组织到细胞和生物标志物的健康(“非患病”)人体综合参考模型,使人们理解人体正常生理状态以及疾病发生机制的重要框架。人类参考图谱(HRA)包含一个通用坐标框架(CCF),其有助于整合多模态数据,如3D器官模型、组织学图像和单细胞分析的组学数据。HRA数据包括由人类专家生成的信息(如解剖系统、解剖结构、细胞类型、生物标志物(ASCT+B)表格以及2D、3D参考对象)、映射到HRA的实验数据,以及丰富的图谱数据。
目前,现有图谱使用特定器官的参考系统,不同数据难以在统一框架下进行整合与分析。为推动CCF发展,2020年3月,美国国立卫生研究院(NIH)和人类细胞图谱(HCA)联盟组织成立了HRA工作组。在过去的55个月里,工作组成员共同定义了HRA关键属性及相关标准操作流程(SOP),确定了有意义的数据、代码和工具,为后续多尺度HRA的构建和应用奠定了坚实基础。相关内容以“Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP): 3D Human Reference Atlas construction and usage”为题发表在Nature Methods上。
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