https://mp.weixin.qq.com/s/EByTINh6ahKTWCgHTcwNMQ环状RNAs(circRNAs)被认为是一组内源性非编码RNAs(ncRNAs)。越来越多的证据表明,circRNA并不是由于剪接错误而产生的无用副产物,它们可能在细胞内具有调节作用。充当miRNA海绵是circRNA最常报道的功能。另外,circRNA可以与相关蛋白结合并调节其生物学行为。像大多数ncRNA一样,由于缺乏明显的开放阅读框(ORFs),circRNA之前被认为是不可翻译的。但是,最近的研究表明circRNA实际上可以编码蛋白质。
CircFNDC3B来源于chr3中FNDC3B基因的外显子5和6,最近发现其在先前的研究中具有一定的功能。有研究报道了circFNDC3B通过充当miR-1178-3p海绵作为膀胱癌的一种肿瘤抑制因子。另一项研究表明,circFNDC3B与IGF2BP3相互作用促进胃癌的迁移和侵袭。虽然miRNA的海绵作用及其蛋白质结合作用受到了一定的关注,但关于circFNDC3B的蛋白质翻译过程的报道却很少。为了探索其潜在的蛋白质编码能力,将circFNDC3B与circRNADb(
http://202.195.183.4:8000/circrnadb/circRNADb.php)进行匹配,发现了一个预测的ORF。然而,尚不清楚circFNDC3B编码的预测蛋白是否存在于CC中,以及是否在CC中发挥作用。
为了解决这些科学问题,中山大学附属第三医院张磊和郑俊研究组于2020年4月2日在Molecular Cancer期刊上发表了题为A novel protein encoded by circFNDC3B inhibits tumor progression and EMT through regulating Snail in colon cancer的研究成果。该研究揭报道了一种circRNA编码的新型蛋白circFNDC3B-218aa,揭示了circFNDC3B-218aa通过减轻Snail对FBP1的抑制作用,从而抑制肿瘤的进展和EMT。暗示circFNDC3B-218aa可能作为一种肿瘤抑制因子和潜在的生物标志物,为CC的治疗提供潜在的靶点。
首先,研究人员使用Sanger测序和RNase R消化实验确认了circFNDC3B的存在,并使用qRT-PCR评估circRNA的表达,发现circFNDC3B在CC细胞系和组织中显著下调。此外,circFNDC3B低表达组患者的OS比高表达组患者短(P = 0.0014)。
随后,通过荧光原位杂交(FISH)实验以确定circFNDC3B的定位,发现CircFNDC3B主要分布于细胞质中。
为了探讨circFNDC3B-218aa对CC细胞系的潜在调控机制,研究人员进行了RNA-Seq分析以鉴定circFNDC3B-218aa调控的基因,结果发现了4个存在差异表达的基因。并且发现在circFNDC3B-218aa组中,Snail表达下调,FBP1表达上调。进一步的实验证实了circFNDC3B-218aa对CC EMT具有抑制作用,并调控了Snail和FBP1的表达。
最后,研究人员对circFNDC3B-218aa进行了葡萄糖代谢相关测定,以进一步研究其功能。发现circFNDC3B-218aa是通过抑制Snail-FBP1信号轴,促进糖酵解向氧化磷酸化的代谢重编程,进而抑制CC细胞EMT的进展。
原文:Pan, Zihao, et al. "A novel protein encoded by circFNDC3B inhibits tumor progression and EMT through regulating Snail in colon cancer." Molecular Cancer 19.1 (2020): 1-15.
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