Nature连发了两篇COVID-19的宏基因组研究。


哥大在Nature报道了对于COVID-19患者剖检肺组织的单细胞测序结果。这项研究分析了19例COVID-19死亡患者肺组织的单细胞测序结果，发现这些死亡患者肺部具有严重炎症，并含有大量异常激活的单核细胞来源的巨噬细胞和肺泡巨噬细胞浸润，且表现出T细胞反应异常。与其他病毒和细菌引起的肺炎相比，单核细胞/巨噬细胞来源的IL-1β和上皮细胞来源的IL-6是SARS-CoV-2感染的独特特征。2型肺泡细胞由于炎症未能完全转变为1型肺泡细胞，从而导致肺再生受损。研究还发现了特殊的CTHRC1+成纤维细胞呈现病理性扩增，从而导致了COVID-19中迅速发生的肺纤维化。这项研究还通过蛋白质-蛋白质相互作用，发现了一系列药物靶点。

Broad研究所开展了类似研究，绘制了来自于COVID-19死亡患者的23个肺，16个肾，16个肝和19个心的单细胞测序图谱，以及14个肺组织样本的形态学图谱。与哥大研究类似的发现是2型肺泡细胞分化不良以及成纤维细胞和TP63 +肺基底祖细胞扩增。肺中单核吞噬和内皮肺细胞富含病毒RNA，而肺中病毒RNA的存在与宿主炎症反应具有空间相关性。对其他组织图谱的分析显示，患者心脏组织中多种细胞类型均发生转录变化。研究还基于COVID-19 GWAS绘制了与疾病严重程度有关的细胞类型和基因图谱。


https://www-nature-com-443.webvpn.sysu.edu.cn/articles/s41586-021-03569-1_reference.pdf
https://www-nature-com-443.webvpn.sysu.edu.cn/articles/s41586-021-03570-8_reference.pdf
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