Nature报导标题:一种让人担忧的新冠变异毒株是如何悄悄扩散的
19重变异,到底具备哪些特性?
Nature 之所以说这种变异株是“悄悄”扩散,是因为发现它“身怀绝技”的时候,实在有点晚了……
B.1.620早在今年2月就在欧洲出现,但是直到4月,立陶宛的研究者才对它进行了测序,这才暴露了它19重变异的身份。而立陶宛研究者之所以会对它进行测序,和立陶宛快速上涨的感染率有关,美国研究者推测B.1.620是当地疫情上扬的罪魁祸首。
那么,这19重变异到底有多强悍呢……看下面这张图。这是立陶宛研究者发布的预印本中的测序结果,第一行是B.1.620的变异点,图中所有涂色的格子都代表病毒具有这个变异点,红色的格子代表只有B.1.620拥有这个变异。
毒王争霸表,最后一行是最近抢眼的印度变异株,第一行是把变异表塞得满满当当的B.1.620。“明星”变异株P.1和B.1.351也在其中
可以看到,E484K这个臭名昭著的变异点——可以免疫逃逸——赫然在列。此外S477N这个变异点同样具备免疫逃逸能力。也就是说,B.1.620至少拥有两个免疫逃逸位点,而之前那些横扫南美威震欧洲雄踞印度的P.1、B.1.617、B.1.351之类的,可都只有一个免疫逃逸变异位点。
除了两个具备免疫逃逸能力的变异位点,在预印本中,研究者分析,B.1.620的N端结构域 (N-Terminal Domain,简称NTD) 的综合突变情况使得它能对抗中和抗体。
同时,B.1.620具备的P681H是能够增加传播性的,之前一度把英国闹得手忙脚乱的高传播性变异株B.1.1.7也拥有这个变异位点。
研究指出,这个19重变异的变异株中,有相当多变异点的功能和性质现在无法明确,因此,并不是说它只有三个变异位点有着危险的特质,而是剩下的某些变异暂时超出人类的知识范畴了……
这满满当当的一大排变异里是否还会有什么“惊喜”和“惊吓”,现在还说不清楚。Science在针对这一变异株的报导中直接指出,“它是那种典型的需要拉响所有警报 (raise all red flags) 的变异株”。
B.1.620的传播情况如何?
根据目前掌握的证据,研究者倾向于这种病毒起源于中非共和国和喀麦隆,通过航班传播至欧洲。但是由于非洲缺乏检测能力,该病毒在非洲的传播情况和覆盖面暂时无法得知。
而欧洲此前疲于应对P.1、B.1.617、B.1.351等变异株引发的疫情,而同时由于新冠病毒的变异速度极快,变异株非常多,使得欧洲也无法及时地筛出这株具备巨大威胁的新变异。研究保守估计,B.1.620在欧洲仍以旅行传播为主,暂且不能断言已经进入社区传播状态。
但不能否认的是,它已经在欧洲多点开花了……下图为研究者统计到的检出并上报的携带B.1.620的患者分布情况,色谱图标代表他们的旅行史,顶端的树状图显示的是病毒谱系,红色圈代表最早发现有旅行史的患者。从图中可以看到在欧洲检出的B.1.620变异株有一部分至少已经繁殖了两代了……
B.1.620在欧洲的分布和谱系图
据推测,B.1.620最早可能2月登陆欧洲,到4月得到的数据如图所示,还处在零零散散的状态。现在我们不能再以“没有快速传播说明它不厉害”而掉以轻心了,正在把南亚变成地狱的B.1.617也并不是一开始就立刻占领主要“市场份额”的,而B.1.620很可能有着比B.1.617更强的免疫逃逸能力,疫苗对它到底能起多大效果,依然未知……
B.1.617已经在逐渐接近我们,面对携带更多危险因素的B.1.620,“提高警惕,扎紧篱笆”,仍是一条必行之策。
参考文献
1.Gytis Dudas, Samuel L, Guy Baele,et al.Travel-driven emergence and spread of SARS-CoV-2 lineage B.1.620 with multiple VOC-like mutations and deletions in Europe medRxiv 2021.05.04.21256637; doi:
https://doi.org/10.1101/2021.05.04.212566372.
https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/984274/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_10_England.pdf3.Meredith Wadman. Scientists tracking coronavirus variants struggle with global blind spots. doi:10.1126/science.abj4775
4.Smriti Mallapaty. How a worrisome coronavirus variant spread unnoticed. doi:
https://doi.org/10.1038/d41586-021-01285-45.
https://www.dw.com/en/covid-19-african-variant-reveals-sequencing-lag/a-575863186.
https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern来源:医学界
责编:李珊珊
校对:臧恒佳
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【 在 purplesoul 的大作中提到: 】
: 欧洲发现新冠新病毒株,毒力远超印度“三重变异株”
:
: 医学界
: 2021-05-21 23:58
: 19个突变,2个能免疫逃逸的变异点……
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: 撰文 |姜飞熊 妮娜
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: 随着印度疫情震慑全球,印度的三重变异毒株声名远播,让人觉得蛊王已经诞生。然而,B.
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发自「今日水木 on Redmi K30」
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