科技部管理经费
在科技部新增加“医学科学基金会”，发挥其熟悉基金管理的经验。不在卫生部增加不熟悉的经费管理功能，而卫生部集中关心全国人民的健康；
科技部的国家实验室管理职能交给科学院。
科学院管理应用研究
国家实验室归科学院管理。发挥其结构管理的特长。可以将其应用的研究所和其他研究所主要做应用的科学家转入国家实验室；
国家实验室不仅应用导向，而且应该主要是需要大团队、大设施、大平台的研究（三者必居其一）。
科学院不需要大团队、不常用大设施、不依赖大平台的基础研究，并入高校。
高校主要基础研究
高校也可以有无需大团队、大设施、大平台的应用研究。
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