由北京华大基因研究中心著名专家学者以及奋战在第一线的科研工作者们组织的“华大基因”研修班具备雄厚的师资力量,世界一流的仪器设备,为生物各学科的研究人员及在校学生提供了一个学习、交流和合作的平台。首届“华大基因”研修班开办时间为2006年4月—2006年10月,平均每月2期,每期历时2天。共有十二期专题,具体日程安排如下:
日期 专题
04月15日-04月16日 中小基因组组装与分析
05月13日-05月14日 EST专题
05月27日-05月28日 基因芯片设计及分析
06月10日-06月11日 分子进化与序列比对
06月24日-06月25日 基因与健康
07月08日-07月09日 微生物基因组系统研究
07月22日-07月23日 资源生物优良性状的基因组学研究
08月12日-08月13日 比较基因组与进化研究
08月26日-08月27日 蛋白质组学研究思路
09月09日-09月10日 特殊性状的表达谱研究
09月23日-09月24日 蛋白质组学相关生物信息分析
10月14日-10月15日 多态性检测与遗传分析
第一期--中小基因组组装与分析(火热报名中)
开课时间:2006年4月15日-2006年4月16日
开课地点:北京华大基因研究中心(北京中心)
主讲老师:
李松岗,北京大学教授。1984年毕业于北京大学生物系,毕业后在北京大学生命科学院任教,从事教育和研究工作。1992年赴美国加州大学洛杉矶分校生物学进修。早期研究生态系统的计算机模拟,近年来从事生物信息学研究工作,曾参与水稻基因组测序、拼接、信息学分析等项目完成。目前受聘于北京基因组研究中心/北京华大基因研究中心。
课程介绍:
一个物种的基因组序列信息是该物种的蓝图,通过它我们不仅可以对该物种有一个全面了解,还可通过比较研究许多重要的进化问题。当需要深入研究某一基因的调控与功能时,基因组序列也是重要参考资料。因此获取基因组信息常常是深入研究一个物种的第一步。本专题系统介绍基因组测序、组装和常规分析的原理、方法、研究案例以及常用软件的使用,并配有相应的上机实习。专题内容紧密联系实际,力求使参加者通过研讨和实习掌握相关软件的使用,具备进行相关研究的能力。
课程安排:
一、2006年4月15日,授课形式:讲课。
1、基因组组装与分析的策略、原理和案例
a.基因组序列是最基本的信息,也是最有力的工具
b.两种测序策略与组装方法
i. 两种测序策略
ii. contig组装
iii.scaffold组装
iv. 基因组定位
v. 组装错误的检验与纠正
c.重复序列识别与分析
i. 数学定义的重复序列与生物定义的重复序列
ii. 重复序列的主要类别与生物意义
iii. 识别重复序列的方法:软件与数据库
d.基因识别
i. 三种技术路线:从头预测、保守序列分析、EST比对
ii. 从头预测算法
e.基因的功能分类
f.案例:水稻、鼠疫杆菌测序
2、AM11组装软件+finish方法
3、重复序列恢复、识别和分类
4、基因注释:BGF、Genescan、Glimmer
5、基因功能分类:GO、KEGG、基于EST的表达谱分析
二、2006年4月16日,授课形式:上机实习。
1、组装软件+finish
2、重复序列恢复、识别和分类
3、基因注释:BGF、Genescan、Glimmer
4、基因功能分类:GO、KEGG、基于EST的表达谱分析
申请人条件:生物、医学、计算机、数理各学科的科研人员及在校学生。
名 额:为保证培训质量,每期只招收50名学员。
培训费用:每期报名费600元人民币,包括学费、材料费以及上机费。食宿可统一安排,费用自理,交通费用自理。以上为单项报价,参加两场培训者可以给予9折优惠;参加三场以上(含三场)培训者可以给予8折优惠。团体报班2人给予9.5折优惠;3-5人给予9折优惠;6人以上(含6人)给予8折优惠。学生凭学生证报班给予5折优惠。在每期专题开讲前15天汇出报名费者给予9折优惠。除学生不再享受团体优惠外,其他优惠可叠加。
培训地点:北京华大基因研究中心北京中心或杭州中心。第一期在北京中心。
报名方式:请有意参加者在每个专题开讲前15天将回执发到以下信箱:liuxiaojin@genomics.org.cn,或者电话报名:010-80481422(刘小姐)
汇款方式:开户银行:中国银行空港万科支行
账 户 名:北京华大基因研究中心
账 号:15970908091001
想对我们了解更多,请登录以下网站查询详细信息:
http://www.big.ac.cn(中国科学院北京基因组研究所)
http://www.genomics.org.cn(北京华大基因研究中心)
http://dnaseq.genomics.com.cn(华大基因生物信息大平台)
热忱欢迎各位有识之士报名参加。名额有限,报名从速。
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