- 主题:水溶液里结晶出来的膜蛋白,其结构会和在细胞膜的一样么? (转
【 以下文字转载自 LifeScience 讨论区 】
发信人: vagab0nd (orz), 信区: LifeScience
标 题: 水溶液里结晶出来的膜蛋白,其结构会和在细胞膜的一样么?
发信站: 水木社区 (Sun May 12 21:03:08 2013), 站内
忽然想起这么一个问题?
现在膜蛋白的晶体都是在水溶液里长出来的吧?
那结晶体得到的结构会不会和它们本来在膜蛋白(非极性)环境里的不一样?
多谢指点
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FROM 218.199.207.*
很复杂的问题,
肯定是不一样的,但问题是构象差别到底多大不好说
【 在 vagab0nd (orz) 的大作中提到: 】
: 【 以下文字转载自 LifeScience 讨论区 】
: 发信人: vagab0nd (orz), 信区: LifeScience
: 标 题: 水溶液里结晶出来的膜蛋白,其结构会和在细胞膜的一样么?
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FROM 166.111.243.188
有的差多有的差少吧
确实很难讲
坐等大牛来普及
【 在 c2h2c2h2 (飞飞飞扬) 的大作中提到: 】
: 很复杂的问题,
: 肯定是不一样的,但问题是构象差别到底多大不好说
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FROM 130.49.204.*
不加表面活性剂很多膜蛋白根本不溶于水溶液或者性质不均一. 能够结晶出来的基本都有表面活性剂分子的存在, 有的根本就是在磷脂里长出来的. 这些情况至少可以认为模拟了细胞膜的非极性环境. 其他生化数据也可以用来验证结构是否和其他方法得到的结果一致, 比如交联的结果和某些二级结构的相对位置十分一致.
如果担心的是蛋白的折叠问题, 那么最有效的方法是测活性, 次一点的可以用圆二色谱或者Tm看蛋白折叠是否正确.
再退一步讲, 晶体能看到的只是蛋白n个构象中的一个或者几个, 取决于能量, 结晶条件, 其他蛋白/抑制剂/...的存在... 即使是胞浆蛋白的晶体结构也不一定能保证捕捉到活性构象. 但如果晶体结构可以解释之前的生化/细胞/动物数据, 特别是突变体的性状, 可以认为晶体结构是正确的
【 在 c2h2c2h2 (飞飞飞扬) 的大作中提到: 】
: 很复杂的问题,
: 肯定是不一样的,但问题是构象差别到底多大不好说
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FROM 134.174.21.*
这个问题很大,因为任何检测都会对原有状态有所影响。比如一对正负电子,
你检测到了正电子,原有的“电子对”也就不是原来的状态了。所以在一定
可信度的范围之内,只能承认其差别性为“不明显”。
【 在 vagab0nd (orz) 的大作中提到: 】
: 【 以下文字转载自 LifeScience 讨论区 】
: 发信人: vagab0nd (orz), 信区: LifeScience
: 标 题: 水溶液里结晶出来的膜蛋白,其结构会和在细胞膜的一样么?
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FROM 202.118.20.71