重庆站（菜园坝）关停后，重庆南站目前只有一趟客车了：重庆南-内江5612/1次。未来的新重庆南站有可能在巴南区南彭街道，即由目前的东环铁路南彭站升级。
待重庆东站、重庆站（菜园坝）建成与改造后，重庆主城区的客运站点分布为：重庆站（菜园坝）、重庆北站（龙头寺）、重庆西站（上桥）、重庆东站（茶园）4主，重庆南站（南彭）、沙坪坝站、科学城站3辅格局。
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