1859年第二次意大利独立战争后，撒丁王国从奥地利手中收复伦巴底地区，加里波第则在两西西里王国发动革命，推翻波旁家族的君主。加里波第试图在南意大利建立共和国，但撒丁尼亚王国请求法国出兵，将意大利南部纳入自己的版图。在得到法国的允许后，撒丁尼亚军队于1860年挥师南下，先在当地居民的配合下征服教宗国东部三分之二的领土，随后进入两西西里王国。当年年底，这些被征服的领土都被撒丁尼亚王国正式吞并，统一的意大利王国正式诞生。此时教宗国仅剩下以罗马城和拉齐奥地区为中心的三分之一领土。1861年3月，意大利王国宣布罗马为新首都。但由于法国驻军的存在，意大利无法收复罗马城。

1870年普法战争爆发，驻扎在罗马的法国军队撤回国内。意大利国王维托里奥·埃马努埃莱二世不必再顾忌法国的威胁，将教宗国纳入意大利版图的时机已经到来。他先派特使向教宗庇护九世送去密信，并提出一个保全圣座脸面的解决方案：意大利军队以“保护教宗”的名义和平进驻罗马城。但这个提议被教宗拒绝，因此意大利于1870年9月10日对教宗国宣战。意大利军队在9月11日越过边界，缓慢向罗马城推进。进军速度非常缓慢，以等待外交协调解决的可能。

虽然教宗国仅拥有一支为数甚微的军队，但庇护九世还是下令进行抵抗，以造成这样的法理事实，即教宗国是被意大利以武力入侵、而非和平接管所征服的。9月19日，意军包围罗马城。1870年9月20日，经过3个小时的炮轰，意军在罗马城的奥利留城墙上轰塌一个缺口，随后进入罗马城，在阿庇亚大道上举行盛大的入城式，教宗国首都被占领造成实质上的灭亡（但于1929年签署《拉特朗条约》后，教宗才正式承认教宗国灭亡）。

此后，经过公民投票，罗马城和拉齐奥地区并入意大利，意大利王国的首都旋即从佛罗伦斯迁到罗马。49名意大利士兵和19名教宗国士兵在这场战役中丧生。

在攻陷罗马城之前，作为和谈的条件之一，意大利王国曾经提议以台伯河为界，将河西“利奥城墙”以内的西半部罗马城保留给教宗，并允诺圣座可以在此城内建立一个完全独立的主权国家，但是这个提议遭到教宗庇护九世的拒绝。

罗马城被意大利吞并后，圣座在罗马城以及意大利各地的地产、宫殿、庄园纷纷被没收，连教宗的正式宫殿——奎里纳尔宫也被没收，成为意大利皇宫。庇护九世退缩至梵蒂冈城堡内，并宣布自己为“梵蒂冈之囚”，以示对意大利强行吞并教宗国的抗议。在“梵蒂冈之囚”这段时间里，教宗将自己禁锢在梵蒂冈城堡内，其活动范围最远只达圣伯多禄大殿广场入口，教宗也不再巡幸其主教教堂——位于罗马城另一端的拉特朗圣若望大殿，以及罗马郊外的行宫。

由于教宗国在历史上是一个独立的主权国家，不过在与国际往来上是以圣座的身份和许多国家互派外交使节，并作为一个国家得到各国的承认。意大利的共和主义者如加里波第等人建议进军梵蒂冈城，完全消灭掉教宗的世俗权力，但是这个提议在意大利国内没有被占优势的保守派民族主义者接受，梵蒂冈城继续保持独立状态，而意大利也无法完全无视这一事实。庇护九世之后的历代教宗均敌视新的意大利王国，甚至不准信徒担任意大利王国的公职。

所谓“梵蒂冈之囚”时期从1870年一直延续至1929年。此时意大利统一已有59年，圣座对意大利的长期敌视和抵制已经显得不合时宜。1929年2月11日，教宗庇护十一世的代表与意大利王国代表在罗马的拉特朗宫签署解决双方悬案的最终协议，即《拉特朗条约》。

根据《拉特朗条约》的规定，圣座最终承认意大利的统一以及罗马成为意大利首都。意大利王国承认教宗在梵蒂冈城堡内至高无上的权威和世俗统治权力，梵蒂冈城堡成为独立的梵蒂冈城国。此外，条约还规定天主教及教会在意大利的政治地位，意大利王国对意大利统一战争期间没收的教会财产进行最终赔偿。从法理上说，延续11世纪的教宗国在1929年2月11日这一天正式灭亡，由梵蒂冈城国取而代之。
【 在 negate 的大作中提到: 】
: 教宗国最大时版图有多大？
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