1963年新加坡合并到马来西亚后，东古拉赫曼与新加坡尤其是与其领导人李光耀关系并不和谐，甚至时常纠纷，最终导致新加坡于1965年8月被迫脱离马来西亚宣布独立。

1964年12月9日，东古拉赫曼在新加坡大学医学院晚宴上发表讲话时说，新加坡“充满政治花招”，“比方说，你会发觉新加坡比马来西亚其他地方较少和谐的气氛……这就是我当初不急于把新加坡引进马来西亚的原因”。他说：“如果我们觉得哪一种征税看来行不通，或是引起反对，我们可加以修改……”但又说：“如果新加坡 各种色彩和闪光（闪电是人民行动党的徽记）的政治人物不同意我的见解，唯一的解决办法便是脱离马来西亚，但这对新加坡和马来西亚来说都是天大的灾难。”[1]

1964年12月19日，东古拉赫曼在吉隆坡同李光耀会面时表示：

“    新加坡的华族沙文主义者和华族共产分子太多了，由于新加坡是个华人的州，你必须替华人做许多事，这不免会引起马来亚的某些反响。（来自马华公会的教育部长）李孝友现在想要在马来亚设立一所华文学院。一旦我们分开，你们就可以有不同的做法，你们可以承认南洋大学，你们的语文政策也可以有所不同，我们想清楚之后，可以通知英国。    ”
——东古拉赫曼[2]
李光耀在其回忆录指多人指责他恶意中伤东古拉赫曼、他的部长以及马来西亚。李光耀为此通 过其政治秘书发表声明说，本身所说的一切都录了音，必要时可以检查，说过的一切都算数。李光耀在一次针对马来人特权发表其看法后，东古拉赫曼警告新加坡的领袖说，在任何事情上，中央政府都不能任由州政府摆布，新加坡是在“张大了眼睛，自愿的情况下”加入联邦的，否则“新加坡也许会成为第二个古巴，我们的地位会维持不下去……所以中央政府才支持人民行动党，行动党获选执政后，我们认为新加坡不再受到共产党人的威胁，却万万料不到行动党的领袖原来打算共同治理马来西亚。我们认为这是不行的，因为联盟够强大，能自行治国”[3]。

1965年5月27日，李光耀在马来西亚联邦国会做了重要的一次发言，其对象包括受《马来前锋报》日日进行反人民行动党、反李光耀和反华宣传影响的许多马来国会议员。李光耀提出修正动议，对施政方针没有向国家保证马来西亚将继续根据民主宪法的规定，朝“马来西亚人的马来西亚”的方向前进而表示遗憾[4]。李光耀的发言也再度提到马来人特权，他说：

“    如果我们欺骗人民，使他们相信他们之所以穷，是因为没有特权，或者是因为国会里的反对党议员反对马来人的权利，那会导致怎样的后果？你让甘榜（乡村）里的人们相信，因为我们不会说马来语，政府文件不用马来文，他们才会穷，他们就会期待1967年（马来语成为国语和唯一官方语言的一年）出现奇迹：一旦我们大家都开始说马来语，他们的生活水平就会提高。但是如果这种情形没出现，会有什么事情发生？    ”
“    另一方面，每逢经济、社会和教育政策失败时，你都重复说，哦，这些邪恶的华人、印度人和其他的人反对马来人的权利。他们并不反对马来人的权利。作为马来西亚公民，马来人有权提升自己的培训和教育水平，同竞争能力比较强的社会、非马来人的社会达到的水平一样。该做的就是这样的事，难道不是吗？而不是向他们灌输这种隐晦的理论：只要让少数特殊的马来人获得马来人的权利，他们的问题就解决了……    ”
——李光耀[5]
李光耀的发言使包括东古拉赫曼在内的马来国会议员不安，以致时任议长裁决，对于反对李光耀论点的发言，李本人没有机会答复[6]。时任副总理敦阿卜杜勒·拉扎克在总结辩论时对李光耀做出了百般指责，包括指他存心制造混乱和麻烦，希望成为能拯救国家的领袖；是个擅长无中生有、危言耸听的高手；歪曲事实，使人们产生怀疑；打算使国家一分为二：“一个是马来人的马来西亚，一个是李光耀的马来西亚”。结束时阿卜杜勒·拉扎克满怀仇恨地说：“人民行动党和联盟的分野眼下一清二楚，人民行动党（PAP）意味着使国家分裂和毁灭（Partition And Perish）[7]。李光耀的发言是导致东古拉赫曼最终决定将新加坡驱逐出马来西亚的直接原因之一[8]。

12年后，1977年东古拉赫曼在其著作《回顾》书第120页写道：“最使人无法忍受的是李光耀在联邦国会中就‘感谢最高元首1965年5月发表御词的动议’提出修正时所发表的演讲。在这次演讲中，他提出了许多问题，最能容忍的国会议员都感到不耐烦。”（东古拉赫曼之后将该书送给李光耀，在扉页上写道：送给对马来西亚的创立异常卖力，对马来西亚的分裂更加卖力的朋友李光耀——谨致问候。东古拉赫曼 1977年5月26日）五年之后，1982年东古告诉一本书的作者（这本书的内容同新加坡有关）：“他（李光耀）马来语说得比我好，便自以为名正言顺地跟我一样，有资格成为马来亚的领袖。”[9]

分家后
即使新加坡已独立出去，东古拉赫曼领导的马来西亚依旧和新加坡有过纠纷。1966年，新加坡总理李光耀从4月起离开新加坡两个月。在此期间，东古拉赫曼、副总理阿卜杜勒·拉扎克、加查利群起攻击时任新加坡副总理杜进才和李光耀，因新加坡看似准备在马来西亚之前同印尼重建邦交。东古拉赫曼恫言要采取报复行动。杜进才对印尼决定承认新加坡表示欢迎，马来西亚政府却对此十分不高兴，还发出声明：

“    新加坡决定欢迎印尼承认它，清楚显示新加坡将会跟印尼有某种联系或交往，因此将会有印尼人到新加坡去，显然地，这么一来，我们的安全将受到威胁，因为印尼一再重申要加紧同马来西亚对抗，因此，马来西亚不得不继续采取一切必要措施，保障它的利益和安全。    ”
——马来西亚政府[10]
紧接着在4月18日，马来西亚内政部长伊斯迈阿卜杜勒·拉赫曼宣布限制持新加坡身份证的人通过长堤入境，新措施立即生效[11]。

在1969年马来西亚大选竞选期间，联盟领袖对新加坡领袖做出无稽的指责，妄说新加坡领袖干预其政治。时任马来西亚财政部长兼马华公会总会长陈修信说，他有“确凿的证据”可以证明，前身是马来西亚人民行动党的民主行动党，若不是拿新加坡政府的钱，就是拿人民行动党的钱。新加坡外交部长拉惹勒南向马来西亚最高专员表达了该国对此事的关注，最高专员也同意这些言论产生了反效果，然而两天后，拉惹勒南向李光耀报告说，东古拉赫曼支持陈修信发表的谈话，声称他们掌握的证据显示所做出的指责属实。东古拉赫曼过后在一个竞选群众大会上说，新加坡的人民行动党领袖企图争夺马来西亚政府的政权，并说：“由于深知不可能赢得华人的选票，所以行动党别无选择，惟有分裂马来人。因此，他们利用泛马回教党作为他们的代理人。”东古拉赫曼表示提供资金给回教党的那个人已被禁止再进入马来西亚，却拒绝透露此人的身份[12]。身在伦敦的李光耀写了一封信给新加坡国防部长林金山称：“对于东古拉赫曼和陈修信的荒唐指责，说我们介入了他们的选举，我有点给搞糊涂了。”[13]

2000年9月，李光耀出版《李光耀回忆录1965-2000》写道：“分家的时候，东古没料到我们会取得成功，他甚至利用三个施压手段要我们听命于他：军事、经济和水供，我们建立了新加坡武装部队，抗衡了军事压力。在经济方面，我们也超越了马来西亚和本区域，同工业国建立了联系。在水供方面，我们有了其他办法。我们的蓄水池能供应40%的家庭用水，再加上好好利用现代科技，如海水淡化、反渗透法、污水再循环，我们应付得了。”[14]
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因为马华公会跪了，但是李光耀不肯跪

【 在 wyid 的大作中提到: 】
: 1963年新加坡合并到马来西亚后，东古拉赫曼与新加坡尤其是与其领导人李光耀关系并不和谐，甚至时常纠纷，最终导致新加坡于1965年8月被迫脱离马来西亚宣布独立。
: 1964年12月9日，东古拉赫曼在新加坡大学医学院晚宴上发表讲话时说，新加坡“充满政治花招”，“比方说，你会发觉新加坡比马来西亚其他地方较少和谐的气氛……这就是我当初不急于把新加坡引进马来西亚的原因”。他说：“如果我们觉得哪一种征税看来行不通，或是引起反对，我们可加以修改……”但又说：“如果新加坡 各种色彩和闪光（闪电是人民行动党的徽记）的政治人物不同意我的见解，唯一的解决办法便是脱离马来西亚，但这对新加坡和马来西亚来说都是天大的灾难。”[1]
: 1964年12月19日，东古拉赫曼在吉隆坡同李光耀会面时表示：
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广东人福建人一向目光短浅，看到的就是兜里的那盆盆罐罐
【 在 zhuzhuxia008 的大作中提到: 】
: 华人去的比猴子还早，结果被后去的猴子以本地人自居赶跑了，广东人和福建人挺菜的，东亚最菜的种族，不过四处做小买卖开小厂子也 ...
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