封建集权，必定是要触及各方利益。
桓玄以荆州之力入主京城，必然要权力对付北府军的势力。
桓玄当时已经把北府军有名望的功臣宿将杀的差不多了，留下刘裕等人，也只是利用性质，迟早是要放抛弃的，刘裕的选择就只有出逃或者起事两条路，没有跟从桓玄的选项。
后来刘裕自己集权，也面临桓玄同样的问题，当年和刘裕一起起事的几个人都没有留存到最后。

【 在 forgauss 的大作中提到: 】
: 桓玄一是夺权以后有些松懈，二是改革触动了一些实力派的利益。
: 刘裕自己也说过，如果桓玄能力强，他就投靠桓玄；如果桓玄
: 不行，再考虑起事。
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