说一个我自己操作过的方法吧。
我用的是PDF-Xchange。

1.首先把两个文件分别放到两个不同的目录下，然后修改成同样的文件名。

2.然后把pdf文件“提取页面”到“单独文件”。
一般来讲，PDF-Xchange会把页数包含到提取后的文件名中。

3.利用cmd的ren命令批量修改文件名。
把第一个PDF文件提取后的单独页面文件的名称后面加上“_A”。
类似，第二个PDF文件提取后的单独页面文件的名称后面加上“_B”。

4.然后把上述文件放到同一个目录下，再利用PDF-Xchange的合并功能对上述文件进行合并。
这个时候PDF-Xchange会自动根据文件名进行排序。
一般来讲会是下面的情形
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xxxx_1_A.pdf
xxxx_1_B.pdf
xxxx_2_A.pdf
xxxx_2.B.pdf
……
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这样就可以交替合并PDF文件了。

这种方法需要注意的一个地方是前10页（或前100页）的页码为单位数字（或两位数字），需要手动调整。
当然也可以利用ren进行批量处理。


【 在 ZhangShao 的大作中提到: 】
: 看了看自己电脑里面装了好多款不同的pdf阅读器，它们所谓的编辑功能都不过是批注啊划线啊签名什么的，就是没有能够更多的编辑功能，我现在是有好几个pdf文件，一个一百页，另一个一百页，想把它们一页一页交叉合并成一个两百页的pdf文件，我就没有办法了，虽然最后可以打印出来再手动合并但是那也太麻烦了吧，能不能先在电脑里面把这些pdf合并好呢？
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修改:Commutator FROM 221.212.116.*
FROM 221.212.116.*