【 在 carbon 的大作中提到: 】
: 用这方法研究的清华荷塘成果登上nature

更正，不是nature，是pnas。

2024年10月9日，颜宁团队在《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表题为“Cry
oSeek：利用冷冻电镜进行生物实体发现的研究策略”（ CryoSeek: A strategy for b
io-entity discovery using cryo-electron microscopy）的研究论文，研究团队将冷
冻电镜作为一种“发现”工具，拓展了人类视觉分辨率的极限，放眼大自然，发现完全
未知的生物大分子。


为验证这一思路的可行性，颜宁团队从清华大学荷塘中取水若干升，经过简单的过滤和
浓缩处理之后，制备冷冻电镜样品并进行数据采集。在电镜显微照片中观察到了自然水
体中丰富多样的生物大分子，其中长短、粗细不一的纤维状结构在样品中占据主导地位
。颜宁团队通过三维重构获得了若干高分辨率电镜密度图；然后利用由清华大学生命学
院副教授、科学探索奖获得者张强锋率团队开发的基于AI算法的CryoNet软件进行自动模
型搭建，很快获得了两种纤维状蛋白的三维结构。生物信息学分析表明这两种纤维状蛋
白来自完全未知的物种，大概率是某些水生细菌表面用于物质传递和辅助运动的菌毛。
所以，在蛋白序列及来源全然未知的情况下，该项研究实现了完全基于结构的生物实体
的物质鉴定和功能预测。清华大学的荷塘因朱自清的《荷塘月色》而闻名，因而研究团
队将本项研究称为“荷糖月色”计划。本项研究所解析的纤维结构仅仅是一个序曲，更
精彩的发现仍在继续。
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