新冠状病毒含HIV相似序列”遭多国学者抨击,作者已要求撤稿!
原创 iseqer 测序中国 今天
近日,一项关于新型冠状病毒(2019-nCoV)含HIV插入片段序列的研究成果引起了众多生物学专家的质疑和讨论。该研究成果由来自印度理工学院德里分校的研究人员在BioRxiv发表上发表。研究结果显示,通过基因序列分析,在2019-nCoV的S蛋白(刺突蛋白)中发现了4个插入片段,且这4个片段是2019-nCoV独有的,在其他冠状病毒中没有检测到这些插入片段。令人惊讶的是,所有4个插入片段中的氨基酸残基均与人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)的复制蛋白gp120或Gag中的氨基酸残基具有相同性或相似性。
研究团队认为,这在自然界不太可能是偶然的。言外之意,2019-nCoV是人为改造的!针对这一荒谬结论,业内多位专家提出了质疑。最终文章作者表示,为避免在世界范围内造成进一步的误解和混乱,已决定撤回当前版本的预印本,并在重新分析后针对修订版中的评论和问题进行修订。
文章作者表示撤稿,来源:BioRxiv
据悉,该研究发布的文章题为“Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag ”。值得注意的是,在文章发布的同时也进行说明了,BioRxiv标注到,BioRxiv正在接收有关冠状病毒2019-nCoV的许多新论文。该研究是未经同行评审的初步报告,不应被视为结论性的,指导临床实践/健康相关行为。
病毒的刺突蛋白(S蛋白)是冠状病毒中研究最广泛的蛋白,也是疫苗开发的关键靶标。病毒的刺突糖蛋白被切割成两个亚基(S1和S2)。S1亚基有助于受体结合,而S2亚基促进膜融合。已有研究表明,冠状病毒的刺突糖蛋白是组织嗜性和宿主范围的重要决定因素。
研究人员首先从NCBI病毒基因组数据库(
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中检索了所有可用的冠状病毒序列(n = 55),并使用GISAID(https: //www.gisaid.org/)检索了截至2020年1月27日的2019-nCoV的所有可用全长序列(n = 28)。经研究发现,2019-nCoV刺突蛋白含有4个插入片段,这4个片段是2019-nCoV独有的,在其他冠状病毒中没有检测到这些插入片段。且在所有可用的2019-nCoV序列中,4个插入片段均绝对(100%)保守。
图:4个插入片段均存在于从GISAID获得的28个武汉2019-nCoV病毒基因组中,来源:BioRxiv
最令人惊讶的是,四个插入片段中的每一个都能与人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)蛋白的短片段对应。如表1所示,2019-nCoV刺突蛋白中插入片段的氨基酸位置可对应HIV-1 gp120和HIV-1 Gag中的相应残基。
表1:2019-nCoV与HIV-1 gp120蛋白序列比对及其在蛋白质一级序列中的位置。来源:BioRxiv
研究人员表示,虽然4个插入片段在2019-nCoV刺突蛋白的一级蛋白质序列中是不连续的,但3D建模表明,4个独特插入片段中至少有3个会聚在一起构成受体结合位点的关键成分。研究团队认为,2019-nCoV的非常规演变在自然界中不太可能是偶然的,这一演变值得进一步研究。
图:2019-nCoV病毒三聚体刺突蛋白建模。来源:BioRxiv
该研究结果的发布迅速引起人们的质疑与讨论,来自多个国家的生物学专家对此持反对意见。
业内专家评论
哈佛大学CRISPR基因编辑专家David Liu教授表示,通过短插入片段就认为2019-nCoV起源“不太可能是自然界偶然的”研究结论不靠谱,纯属阴谋论。
全文链接:
https://mp.weixin.qq.com/s/dnkWnXyvFifM4sdW4ar4uw
--
FROM 113.103.217.*