Cell Reports | 余学清、张镇海和曹广文团队联合揭示人抗体组库的关键特征
BioArtMED BioArtMED 3天前
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抗体组库(Antibody repertoire)是指某一特定个体或组织所包含的全部抗体的集合,它是人类适应性免疫系统的重要组成部分。抗体的多样性源于多个机制,包括生殖系基因片段的重组、连接位点的修饰、体细胞超突变以及重轻链配对等。据估计,这些机制可以产生至少1012种不同的抗体,因此,多样化的抗体能够特异性地识别几乎是无限的潜在免疫原。
早期的技术(即Sanger测序和谱型分析)由于通量小或分辨率低,极大地限制了对抗体组库的研究。然而,高通量测序的出现使人们能够以单个核苷酸的高分辨率同时对数以百万计的抗体进行深入仔细的研究,这一技术被称为抗体组库测序(Ig-seq)。抗体组库测序的出现极大地促进了我们对体液免疫的理解,目前抗体组库测序的应用已在过敏反应、炎症反应、传染病、自身免疫、抗体发现以及疫苗筛选等领域取得了重要进展。特别地,在全球新冠病毒大流行期间,抗体组库测序还被成功地用于新冠病毒感染患者体液免疫动态变化的监视以及针对新冠病毒的中和抗体的筛选。
鉴于其巨大的潜力,研究者们根据特定的研究目的,生产了一批又一批的抗体组库测序数据。然而,由于其难以估量的多样性,单个研究所使用的样本的代表性相当有限。此外,不同的研究通常使用不同的分析流程,这使得不同的研究之间的结果难以相互比较。因此,基于大数据的抗体组库特征描述显得尤为重要。
2021年5月12日,广东省人民医院余学清团队、南方医科大学张镇海团队以及中国人民解放军海军军医大学曹广文团队联合在Cell Reports上线发表了群体水平下人抗体组库特征谱的研究,揭示了包括基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超突变在内的多个抗体组库的关键特征。
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