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主题:轨迹分析_Scanpy进行单细胞分析及发育轨迹推断
purplesoul
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2021-08-31 16:28:16
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越来越多的单细胞测序使用scanpy进行轨迹推断,可能因为scanpy可以在整体umap或者Tsne基础上绘制细胞发育路径,图片也更加美观,但是Scanpy是基于python开发的,下面整理下Scanpy官网给出的流程,按照官网流程跑一遍PBMC的数据。
https://blog.csdn.net/weixin_42493639/article/details/112745234
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FROM 59.41.66.*
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