https://mp.weixin.qq.com/s/pnRcWnPrH-BILZ5WH3Jxpw整合两个分组单细胞的文章
比如文章：《Degenerative and regenerative pathways underlying Duchenne muscular dystrophy revealed by single-nucleus RNA sequencing》，数据集是 GSE156498，很明显可以看到这个数据集里面的两个分组的多个单细胞样品是被整合了的：
再看看不整合的文章
比如：Rosen *et al. Genome Medicine (2022)*的文章，标题是：《Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination》，该研究里面的单细胞转录组样品是4个，分成两组，但是很明显作者在进行这个数据集的降维聚类分群的时候，并没有做整合，而是简简单单合并不同样品。
确实是两个分组的CD4还是CD8的T细胞含量很不一样，但是小胶质细胞其实并不会出现前面的不整合的时候那样的泾渭分明。
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FROM 59.41.66.*