南京鼓楼医院隶属于南京市。

鼓楼医院的所有领导由南京市任命，而且任命大会，南京大学连列席资格都没有。
看鼓楼医院院长任命：

7月31日，南京市委、市政府在南京鼓楼医院召开全院干部大会，宣布鼓楼医院主要领导人事任免决定，会议由市委组织部副部长刘军主持，南京市委组织部部长徐金万、南京市人民政府副市长胡万进和市卫生局局长孙家兴出席会议。（没有南京大学任何领导列席）

看看别家的直属附属医院院长怎么任命的
中科大：

我院召开干部大会 宣布主要领导调整决定

1月5日上午，中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）召开干部大会。中国科学技术大学党委书记舒歌群，安徽省卫生健康委党组书记刘同柱出席会议。安徽省委组织部二级巡视员、省直干部处处长李兆平宣读了安徽省委关于刘连新同志任中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）党委书记，严光同志任中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）执行院长的决定。会议由中国科学技术大学党委常务副书记蒋一主持。
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