2000年，上海医科大学和复旦大学合并办学，组建成为新的复旦大学。
2012年，新的上海医学院成立，作为复旦大学党政的派出机构，根据学校的授权，在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面，行使相对独立的管理权限。
2017年，中共复旦大学上海医学院工作委员会成立，是学校党委的派出机构。
2018年12月21日，教育部、国家卫生健康委员会、上海市人民政府正式签约，共建托管复旦大学上海医学院及其直属附属医院。
2019年6月14日，上海市委决定，建立中共复旦大学上海医学院委员会和中共复旦大学上海医学院纪律检查委员会。同日，复旦大学上海医学院高水平地方高校试点建设正式启动。

复旦还有人事任免权吗?
感觉上，上交对二医，北大对北医的控制力强很多。

跟清华、协和的关系差不多了。
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