万历皇帝20多年不理朝政，造成明朝军队毁灭性打击。《皇明经世文编》记载，徐光启检查防务发现，库存7.09万具火器，能用的就只有4.6万具。内库所贮铜铸火器，如灭虏炮、佛郎机之类，略一试用，便即炸碎。

库存10.5万副盔甲，已经很多年没有翻新修复，很多都已经破损。而选锋之明盔甲七千顶副，则大半多破坏者也。

发现库存武器，只有钢刀可以用，其他枪筅钯镰、长短器械等，全然未备。以至于，只能买杂木棍一千二百根暂时应用。

万历皇帝在职期间，不视朝政、不批答章疏、不赈灾、不补缺官。除了对明朝军事力量造成毁灭性打击，更重要的是造成明朝马政彻底荒废，士兵不是想怎么把马养的膘肥体壮，而是尽快把马整死，自己省事少担任责任，少干活。

万历三十六年，巡按辽东的熊廷弼发现，明军上下对马的态度就是尽快把马整死：辽之不惜马也,起于官不以法绳军;而官与军又图马死以为利。而这个时候距离萨尔浒战役，已经只有11年了。
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