康熙幼年时侥幸从天花的魔爪中逃脱，代价是面庞上终身留有丑陋的伤疤。由此获得的免疫力是他成为皇位继承人的重要原因。

他的父亲顺治皇帝也曾感染天花，但没有获得幸运之神的眷顾。顺治24岁死于天花，这在皇室中并不稀奇，他的胞弟豫亲王多铎也在36岁的时候被天花夺命。
隆庆年间（1567-1572）有了人痘疫苗，但它显然并没有很快“蔓延天下”，所以100年后康熙出生时，皇室还没有被人痘所普及。

凭借自身免疫力从天花中康复的康熙，要到自己登基并生了21个子女之后，才第一次得知人痘的医术。那是康熙十七年（公元1678年），皇太子胤礽四周岁，不幸被传染了天花。康熙网罗天下名医，其中武昌府通判傅为格也被召入宫施诊。胤礽最终获愈，康熙认为是傅为格之功。凭此因缘，傅为格将种痘医术普及到了皇宫。

发端于中国的人痘，堪称人类历史上第一款预防传染病疫苗。康熙将傅为格延揽入宫，开始建立机制，太医院专门设立痘医，给皇子皇孙种痘。流风所及，很多京城高官与旗人子弟，也相率种痘，以抵抗杀人无算的天花病毒。

人痘种植术大大降低了天花患者的死亡率，但仍不能做到万无一失。最著名的是同治皇帝，虽年幼时种痘，但19岁时仍感染了天花，最终不治身亡。
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