如果一些物体(比如液态水)含有电极性分子并且这些分子可自由振荡, 那么他们可被微波炉加热. 当这些物体被置于微波传播空间中, 在微波高频振荡(微波炉常采用 2.45 GHz 的微波)的电磁场作用下, 物体中的电极性分子(尤其是水分子, 可出色地对微波作出响应)的方向会随振荡电场一起振动(转动), 一个分子的固有电磁场被改变并影响临近分子, 于是分子们也会有平动, 这种平动是分子群体温度的主要来源. 虽然非电极性分子也会因电场产生一些位移极化, 但这本身对分子群体的温度几乎没有贡献. 有的食物本身就有自由的电极性分子, 因此可以被微波直接加热; 其他食物只要与水均匀混合, 也可以通过水间接地被微波加热.
金属在微波加热的情况下会产生火花，特别是较尖锐的金属制品(如：叉、罐头食物、易开罐)，因此在使用微波烹调中，不得使用密闭的金属容器或金属网状容器来装载食物，以免发生意外事故。
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